- Ubicada en la Plaza San Juan de la Cruz.
- La nave principal se amplía y se añaden dos laterales desde el presbiterio, creando junto a la sacristía y a varias capillas una planta armoniosa e irregular. La fachada conserva su estilo carmelitano mezclado con pinceladas neoclásicas y barrocas coloniales. La mayor alteración se acomete en 1900, adosando al templo la actual torre-campanario.
- Tenía un cementerio aledaño.
- Posiblemente fuese la antigua Ermita de Ntra Sra de La Peñuela donde San Juan de la Cruz vivió.
- Se conoce, por testimonios e informes de los intendentes, que los frailes carmelitas del convento de La Peñuela poseían una pequeña capilla-oratorio ya en el siglo XVI en este mismo lugar.
- En 1768, Doña Juana de Nava y Vozmediano, dona sus tierras en las Torrecillas y La Peñuela a Carlos III para las nuevas colonias, a cambio de que se edifique una ermita en honor de San Juan de la Cruz. Es entonces cuando se levanta una nueva nave central para ampliar la antigua capilla-oratorio de los carmelitas.
- El antiguo cementerio de esta ciudad se construyó junto a esta ermita, existiendo un osario y cripta bajo la capilla.
- Algunos frailes de La peñuela aseguraron haber visto a San Juan de la Cruz oficiando misa en esta ermita, coincidiendo con el momento de su muerte en Úbeda el 14 de diciembre de 1591; milagro recogido en el cuadro de Sánchez Sola que preside el altar de la capilla.