Se accede desde la Antesacristía por una monumental escalera, obra de Vandelvira, como la cripta
Al final de la escalera y a un costado, un arco de bóveda que se apoya en triple arco.
En el costado se encuentra una portada con arco de medio punto
apoyado en columnas dóricas adosadas que da paso a un vestíbulo de 8,5
por 5,5 metros.
Se entra al Museo propiamente dicho por un arco de medio punto sobre columnas jónicas adosadas A los lados del arco figuras alegóricas que sostienen palma y laurel
Encima del arco, ángeles tenantes que sostienen el escudo del obispo Tavera
Da paso a una sala más amplia que anteriormente era la capilla del panteón, que a su vez precede a otro salón, de menores proporciones, con bóveda de cañón.